La mala absorción de los nutrientes deja disponibles más nutrientes para las bacterias del intestino delgado y esto puede resultar en un excesivo crecimiento de la población bacteriana. Además la mala absorción puede permitir que las proteínas, azúcares y grasas pasen al intestino cecal y causen un cambio en la población microbiana que supere a las bacterias fermentadoras preferidas.
Mantener el equilibrio de una buena salud intestinal es un aspecto fundamental para asegurar el mejor desempeño y óptima salud de las aves.
Los estilos de manejo, el clima, las enfermedades y las materias primas del alimento pueden afectar la salud intestinal. Buenas prácticas de gestión avícola: la crianza, alimentación, agua, bioseguridad y ambiente, todos son aspectos necesarios para mantener la salud, bienestar y desempeño del intestino y por lo tanto de las aves.

